More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0991 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  76.83 
 
 		 167 aa  246  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  75.93 
 
 		 169 aa  244  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  56.21 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  55.24 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  53.06 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  48.65 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  53.74 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  49.35 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  46.36 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  46.98 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  46.36 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  48.98 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  47.02 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  46.36 
 
 		 145 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  45.64 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  44.97 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  44.9 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  47.59 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  44.9 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  40.97 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  38.96 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  39.61 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  37.91 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  39.35 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  36.11 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  37.58 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  39.31 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  35.92 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  38.41 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  43.07 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  38.51 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  39.19 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  33.55 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  33.55 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  37.91 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  39.73 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  38.56 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  37.16 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  40.41 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  37.58 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  34.46 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  33.78 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2535  response regulator  39.2 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  37.42 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  36.88 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  37.5 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.91 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.3 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  34.01 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  36.18 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.95 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.95 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.95 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.95 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.9 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>