More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0979 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  84.65 
 
 
417 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  84.41 
 
 
417 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  66.83 
 
 
405 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  66.58 
 
 
406 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  69.31 
 
 
409 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  68.17 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  65.76 
 
 
406 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  67.09 
 
 
408 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  50.76 
 
 
402 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  43.13 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.24 
 
 
402 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.82 
 
 
420 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.23 
 
 
410 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.09 
 
 
399 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.28 
 
 
410 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.78 
 
 
388 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.25 
 
 
409 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.34 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.61 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.94 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.93 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.7 
 
 
405 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.76 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.74 
 
 
426 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.21 
 
 
407 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.09 
 
 
410 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.45 
 
 
414 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  38.82 
 
 
418 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.63 
 
 
407 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.48 
 
 
404 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.63 
 
 
407 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.06 
 
 
402 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.63 
 
 
407 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  38.59 
 
 
436 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.84 
 
 
407 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.98 
 
 
402 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.2 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.66 
 
 
413 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.5 
 
 
450 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  37.37 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.23 
 
 
399 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  39.01 
 
 
417 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.14 
 
 
419 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.75 
 
 
405 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  33.99 
 
 
412 aa  215  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  37.27 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  33.75 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.34 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.74 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  36.88 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.61 
 
 
423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.86 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.04 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.7 
 
 
405 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.6 
 
 
423 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  36.11 
 
 
406 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.71 
 
 
410 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  35.25 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  35.25 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.45 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  35.25 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.72 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35.06 
 
 
419 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.18 
 
 
398 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  38.9 
 
 
443 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.36 
 
 
423 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.99 
 
 
442 aa  206  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.88 
 
 
412 aa  205  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  35.58 
 
 
408 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.29 
 
 
402 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  35.93 
 
 
414 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  36.54 
 
 
399 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  34.33 
 
 
395 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.66 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.93 
 
 
380 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  33.77 
 
 
415 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.15 
 
 
447 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.15 
 
 
447 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.11 
 
 
402 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.15 
 
 
447 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.64 
 
 
412 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.23 
 
 
401 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  38.56 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  35.14 
 
 
468 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  35.9 
 
 
395 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.83 
 
 
395 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  35.96 
 
 
439 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.17 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  33.16 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.5 
 
 
411 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>