More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0975 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  85.79 
 
 
394 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  85.79 
 
 
427 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  78.68 
 
 
394 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  84.18 
 
 
397 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  83.67 
 
 
409 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  85.79 
 
 
394 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  80.2 
 
 
394 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  85.28 
 
 
394 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  80.46 
 
 
394 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  82.65 
 
 
397 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  84.85 
 
 
396 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  88.58 
 
 
394 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  85.53 
 
 
427 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  80.71 
 
 
394 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  85.28 
 
 
427 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  86.55 
 
 
394 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  83.42 
 
 
397 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  100 
 
 
394 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  87.06 
 
 
394 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  82.23 
 
 
394 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  85.79 
 
 
394 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  84.44 
 
 
397 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  83.67 
 
 
397 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  84.44 
 
 
397 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  77.16 
 
 
394 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  76.14 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  76.65 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  75.89 
 
 
394 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  77.16 
 
 
395 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  74.87 
 
 
394 aa  584  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  74.87 
 
 
394 aa  584  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  72.08 
 
 
393 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.5 
 
 
396 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  67.86 
 
 
396 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  66.16 
 
 
395 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  67.86 
 
 
396 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  67.94 
 
 
395 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  66.75 
 
 
398 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  66.33 
 
 
394 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  66.92 
 
 
395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  67.86 
 
 
395 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  63.17 
 
 
392 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  63.08 
 
 
421 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  63.43 
 
 
394 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  63.43 
 
 
394 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  61.13 
 
 
398 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  63.17 
 
 
394 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 
392 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  64.45 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  62.66 
 
 
394 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  61.64 
 
 
389 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  59.49 
 
 
393 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  59.69 
 
 
395 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  58.82 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  58.97 
 
 
393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  61.11 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
393 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  59.85 
 
 
391 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  60.91 
 
 
394 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  57.11 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  60.1 
 
 
400 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  55.58 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  56.49 
 
 
393 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  59.95 
 
 
389 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  56.35 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  55.98 
 
 
393 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  55.1 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.67 
 
 
402 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.87 
 
 
396 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
393 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
392 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.62 
 
 
396 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
392 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
392 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
392 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 
389 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
392 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
392 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
393 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
393 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
394 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
392 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 
392 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>