More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0875 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  92.41 
 
 
158 aa  290  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  91.14 
 
 
158 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  91.14 
 
 
158 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  91.14 
 
 
158 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  90.51 
 
 
158 aa  286  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  89.24 
 
 
158 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  283  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  88.61 
 
 
158 aa  282  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  87.97 
 
 
158 aa  281  3e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  87.34 
 
 
158 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  86.71 
 
 
176 aa  278  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  79.75 
 
 
158 aa  256  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  79.75 
 
 
158 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  79.75 
 
 
158 aa  255  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 
158 aa  254  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 
158 aa  254  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  79.11 
 
 
158 aa  253  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 
173 aa  252  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  77.07 
 
 
158 aa  251  4e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  75.95 
 
 
158 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  78.48 
 
 
168 aa  248  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  74.68 
 
 
158 aa  244  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  75.95 
 
 
158 aa  241  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  76.43 
 
 
158 aa  240  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  72.15 
 
 
158 aa  240  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
158 aa  237  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  74.68 
 
 
158 aa  236  7e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  72.78 
 
 
158 aa  232  1e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  72.78 
 
 
158 aa  232  2e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  71.52 
 
 
158 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  227  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
172 aa  227  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  67.09 
 
 
158 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  67.09 
 
 
180 aa  224  5e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
158 aa  222  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  70.89 
 
 
158 aa  221  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  67.09 
 
 
158 aa  212  1e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  211  3e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  69.03 
 
 
158 aa  209  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  69.03 
 
 
158 aa  209  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 
159 aa  196  8e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
158 aa  195  2e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.33551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 
166 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 
166 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 
166 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  194  4e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 
158 aa  192  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 
158 aa  191  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  191  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  57.59 
 
 
158 aa  190  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 
164 aa  191  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
159 aa  190  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.10708e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.61642e-05  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.19579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.74781e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.10908e-08  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.58072e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  58.23 
 
 
158 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 
158 aa  188  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  188  3e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  58.86 
 
 
158 aa  187  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.7905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  59.09 
 
 
158 aa  186  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.43014e-05  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 
158 aa  184  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.72965e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 
158 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 
158 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 
159 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
168 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 
156 aa  183  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  58.6 
 
 
173 aa  183  1e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 
158 aa  182  1e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 
154 aa  183  1e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
159 aa  182  2e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
171 aa  182  2e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 
158 aa  182  2e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.49804e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
158 aa  181  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 
158 aa  181  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  4.26484e-12  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  181  4e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  55.7 
 
 
160 aa  180  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 
158 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 
153 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>