267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0782 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  100 
 
 
166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
167 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
167 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
167 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
167 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
167 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  85.28 
 
 
167 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  85.28 
 
 
167 aa  286  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  83.44 
 
 
219 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  86.5 
 
 
195 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
166 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  86.5 
 
 
166 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  79.14 
 
 
166 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  85.89 
 
 
186 aa  270  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  85.28 
 
 
209 aa  270  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  86.5 
 
 
166 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  84.66 
 
 
166 aa  266  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  78.53 
 
 
166 aa  266  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  71.17 
 
 
167 aa  231  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  69.94 
 
 
167 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  69.94 
 
 
167 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  65.03 
 
 
166 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  65.06 
 
 
166 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  48.82 
 
 
170 aa  173  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  55.15 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  54.37 
 
 
162 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
169 aa  166  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  50.93 
 
 
163 aa  166  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
161 aa  158  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
161 aa  158  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
161 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.48 
 
 
161 aa  157  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
165 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
162 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
162 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 
171 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
167 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.12 
 
 
162 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 
163 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 
179 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  52.48 
 
 
162 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
259 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 
177 aa  151  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  51.81 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50 
 
 
176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  51.06 
 
 
162 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  49.36 
 
 
160 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  49.36 
 
 
167 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  49.36 
 
 
167 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  47.2 
 
 
159 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  43.6 
 
 
183 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
159 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
163 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  48.72 
 
 
160 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.72 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
164 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
160 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  51.25 
 
 
164 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 
160 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
178 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.17 
 
 
160 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
166 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
177 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
169 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  48.08 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
166 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
165 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
170 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  48.52 
 
 
166 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
164 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
166 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
164 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
179 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
183 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.43 
 
 
173 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
166 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
172 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  45 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>