More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0761 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  89.8 
 
 
265 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  88.35 
 
 
265 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  84.21 
 
 
265 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  84.64 
 
 
264 aa  414  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  83.52 
 
 
264 aa  414  1e-115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  84.59 
 
 
264 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  84.21 
 
 
264 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  84.59 
 
 
264 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  83.08 
 
 
264 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  75.19 
 
 
266 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  69.89 
 
 
264 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  69.03 
 
 
265 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  71.13 
 
 
272 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  73.68 
 
 
266 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  73.68 
 
 
266 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  73.68 
 
 
266 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  66.11 
 
 
264 aa  342  3e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  73.41 
 
 
264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  73.41 
 
 
264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  65.04 
 
 
281 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  76.47 
 
 
259 aa  339  3e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  60.37 
 
 
270 aa  337  1e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  76.05 
 
 
259 aa  337  1e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  64.04 
 
 
266 aa  337  2e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  63.16 
 
 
266 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  63.16 
 
 
266 aa  335  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  63.67 
 
 
266 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  60.37 
 
 
270 aa  331  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.78 
 
 
268 aa  327  1e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  59.26 
 
 
270 aa  325  4e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  62.03 
 
 
266 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  59.41 
 
 
271 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  61.76 
 
 
262 aa  315  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  61.34 
 
 
258 aa  315  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  57.93 
 
 
271 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  57.93 
 
 
271 aa  314  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  57.93 
 
 
271 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  57.93 
 
 
271 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  57.93 
 
 
271 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  61.41 
 
 
268 aa  314  1e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  58.85 
 
 
259 aa  312  4e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  56.83 
 
 
271 aa  311  7e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.34 
 
 
297 aa  311  8e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  58.46 
 
 
259 aa  311  8e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  60.58 
 
 
268 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  60.92 
 
 
259 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  60.58 
 
 
268 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  61 
 
 
268 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  58.08 
 
 
259 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  61.41 
 
 
268 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  61 
 
 
268 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.34 
 
 
269 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.34 
 
 
269 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  60.58 
 
 
268 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  58.17 
 
 
271 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  56.15 
 
 
264 aa  306  2e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  56.73 
 
 
272 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  57.59 
 
 
266 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  55.38 
 
 
258 aa  305  4e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  57.59 
 
 
259 aa  305  5e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  57.59 
 
 
259 aa  305  5e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  56.36 
 
 
281 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  55.17 
 
 
258 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  55.17 
 
 
258 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  304  8e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  304  8e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  304  8e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  304  8e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  304  8e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.36 
 
 
272 aa  303  1e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  57.2 
 
 
259 aa  303  2e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  59.24 
 
 
257 aa  302  3e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  57.09 
 
 
270 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  59.41 
 
 
529 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  60 
 
 
263 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  58.4 
 
 
257 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  54.79 
 
 
258 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  56.72 
 
 
258 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  57.56 
 
 
257 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  56.02 
 
 
268 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  8.1124e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  56.02 
 
 
268 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  8.95864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  58.44 
 
 
260 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  55.47 
 
 
262 aa  283  2e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  54.36 
 
 
269 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  52.75 
 
 
274 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  63.33 
 
 
246 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  53.53 
 
 
267 aa  274  1e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.53 
 
 
267 aa  274  1e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  52.29 
 
 
278 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  53.53 
 
 
286 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  49.24 
 
 
260 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 
260 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  52.36 
 
 
260 aa  254  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  48.74 
 
 
263 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  51.45 
 
 
262 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  49.04 
 
 
271 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.34725e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.04 
 
 
271 aa  249  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.04 
 
 
271 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  50.55 
 
 
271 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>