65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0734 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0734  GP29  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  68 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  55.56 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  56.41 
 
 
81 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  44.74 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  41.33 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  43.42 
 
 
178 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  42.67 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  45.95 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  43.42 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  43.42 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  40.79 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  42.67 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  42.67 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  40.48 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  43.59 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  39.74 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  44.16 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  37.14 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  38.96 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  44.74 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  43.42 
 
 
453 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  40.26 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  38.96 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  43.24 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  35.62 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  35.62 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  35.62 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  44 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  41.33 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  37.66 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  38.36 
 
 
194 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  40.26 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  34.33 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  36.36 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  35.06 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  36.99 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  38.67 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1929  hypothetical protein  32.88 
 
 
120 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>