More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0529 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  95.79 
 
 
309 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  95.47 
 
 
309 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  91.26 
 
 
309 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  91.59 
 
 
309 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  90.94 
 
 
309 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  90.61 
 
 
309 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  90.61 
 
 
309 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  89.97 
 
 
560 aa  593  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  90.61 
 
 
309 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  90.29 
 
 
309 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  89.64 
 
 
309 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  79.73 
 
 
308 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  78.43 
 
 
307 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  78.81 
 
 
308 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  79.14 
 
 
308 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  76.8 
 
 
307 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  74.26 
 
 
326 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  72.13 
 
 
329 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  73.6 
 
 
326 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  70.83 
 
 
308 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  70.59 
 
 
311 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  72.49 
 
 
310 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  70.82 
 
 
305 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  70.82 
 
 
305 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
309 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  71.29 
 
 
306 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.99 
 
 
305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
302 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
306 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  69.08 
 
 
329 aa  454  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  67.09 
 
 
320 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  66.77 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  69.18 
 
 
306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  58.33 
 
 
300 aa  374  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
303 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
302 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 
311 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  59.06 
 
 
311 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
300 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  57.76 
 
 
304 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  58.59 
 
 
298 aa  358  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  59.73 
 
 
304 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
301 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
312 aa  352  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  58.72 
 
 
303 aa  351  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
321 aa  350  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 
304 aa  348  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  52.73 
 
 
306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
305 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
307 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  52.33 
 
 
303 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 
306 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  54.21 
 
 
306 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  51.79 
 
 
308 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
305 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
306 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 
306 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
303 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 
306 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
303 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
303 aa  319  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
312 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
303 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
307 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
315 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
328 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
308 aa  298  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
308 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
309 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
355 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
310 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
308 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
308 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
316 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
305 aa  293  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  47.8 
 
 
313 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
330 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
308 aa  292  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  292  6e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
313 aa  291  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
319 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>