More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0505 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  82.11 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  69.76 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  69.76 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  69.35 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  67.98 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  69.57 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  67.19 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  64.34 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  71.49 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.96 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  49.59 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0308  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.46 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11729  oxidoreductase  36.43 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123352  normal  0.515207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.08 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.82409  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01396  hypothetical protein  32.56 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0850  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.2 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.40253  normal  0.017932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  35.74 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46093  decreased coverage  0.00000100027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>