More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0493 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  71.69 
 
 		 240 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  68.92 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  71.83 
 
 		 237 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  71.36 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  71.36 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  69.95 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  67.59 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  69.01 
 
 		 237 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0705  HAD family hydrolase  70.42 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531272  normal  0.478044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 232 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  69.48 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2141  hypothetical protein  64.32 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00191152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  51.75 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  51.75 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  51.75 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  44.13 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.19 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  41.51 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  40.85 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  41.04 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  41.04 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  41.04 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.78 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  41.51 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  40.57 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  40.57 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.54 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  41.12 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  41.12 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  53.33 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.21 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  40.37 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.36 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.07 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  36.15 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.09 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.65 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.65 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  38.25 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  33.03 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.99 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  36.53 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.61 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.24 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  34.09 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.19 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.51 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.25 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  37.75 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  34.38 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  34.63 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  35.89 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  38.81 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  34.01 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.81 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  38.54 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.9 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  37.1 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0467  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  36.75 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.38 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>