More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0482 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  77.68 
 
 
481 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  75.77 
 
 
506 aa  725    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
474 aa  929    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  69.49 
 
 
474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  69.43 
 
 
524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  69.49 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  69.49 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  66.39 
 
 
483 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  63.73 
 
 
503 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  65.42 
 
 
483 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  65.42 
 
 
483 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  65.29 
 
 
488 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  66.18 
 
 
478 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  65.08 
 
 
488 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  66.55 
 
 
525 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  66.55 
 
 
525 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  47.91 
 
 
472 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  48.54 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  46.36 
 
 
481 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  45.79 
 
 
478 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  42.2 
 
 
477 aa  289  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  35.38 
 
 
509 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.8 
 
 
500 aa  249  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.53 
 
 
518 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  35.99 
 
 
494 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.72 
 
 
501 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.21 
 
 
511 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  35.88 
 
 
496 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.67 
 
 
493 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.7 
 
 
502 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.15 
 
 
492 aa  226  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.15 
 
 
492 aa  226  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.36 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.25 
 
 
509 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  34.76 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.49 
 
 
500 aa  220  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.08 
 
 
498 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  36.69 
 
 
484 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.26 
 
 
493 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.78 
 
 
490 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  37.41 
 
 
484 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.89 
 
 
511 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33 
 
 
515 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.71 
 
 
488 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.78 
 
 
509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  33.54 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  34.92 
 
 
493 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.15 
 
 
487 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  36.96 
 
 
490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  36.96 
 
 
490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  36.59 
 
 
484 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  36.96 
 
 
490 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  36.96 
 
 
490 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.14 
 
 
512 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  36.02 
 
 
492 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.54 
 
 
496 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  35.93 
 
 
483 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  35.93 
 
 
483 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  35.62 
 
 
489 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.17 
 
 
491 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.55 
 
 
496 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.03 
 
 
499 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  35.7 
 
 
492 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.95 
 
 
493 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  33.81 
 
 
493 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.68 
 
 
493 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  36.51 
 
 
484 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  33.81 
 
 
493 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  31.4 
 
 
486 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.49 
 
 
494 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  36.94 
 
 
493 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  36.94 
 
 
493 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  36.94 
 
 
493 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33.94 
 
 
493 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33.94 
 
 
493 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.29 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  35.7 
 
 
533 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.72 
 
 
489 aa  200  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  35.37 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  36.67 
 
 
508 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  34.86 
 
 
483 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  36.53 
 
 
484 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  32.99 
 
 
495 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  34.12 
 
 
486 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  33.97 
 
 
486 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  34.36 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  34.48 
 
 
492 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  34.48 
 
 
492 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  34.36 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  34.36 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  34.36 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  36.4 
 
 
499 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  34.27 
 
 
492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  33.89 
 
 
486 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  33.73 
 
 
486 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  35.11 
 
 
492 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.83 
 
 
511 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.56 
 
 
499 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  32.85 
 
 
486 aa  187  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  35.21 
 
 
478 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>