More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0470 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.73 
 
 
445 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.53 
 
 
433 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  76.62 
 
 
438 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.5 
 
 
445 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
433 aa  853    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.88 
 
 
448 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  84.06 
 
 
433 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  76.39 
 
 
438 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  76.73 
 
 
448 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.73 
 
 
448 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.73 
 
 
448 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.96 
 
 
448 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  50.68 
 
 
438 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
438 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  50.45 
 
 
438 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  48.67 
 
 
444 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  44.39 
 
 
442 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  48.44 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
458 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
458 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
461 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  42.47 
 
 
459 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
444 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
456 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
459 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
459 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
459 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
459 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  42.47 
 
 
449 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  42.25 
 
 
1093 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  42.72 
 
 
455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 
454 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
475 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  41.55 
 
 
441 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
450 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  45.15 
 
 
442 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
466 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
453 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  42.32 
 
 
487 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  38.16 
 
 
449 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
449 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
445 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  36.76 
 
 
471 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  36.22 
 
 
471 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.36 
 
 
446 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
437 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  34.91 
 
 
439 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
439 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  36.12 
 
 
478 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  36.12 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  42.81 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  30.13 
 
 
467 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  39.8 
 
 
501 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
446 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
478 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
442 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
450 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.62 
 
 
513 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
461 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
487 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
481 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  36.1 
 
 
472 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
457 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  44.36 
 
 
467 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
431 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
465 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  34.62 
 
 
457 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34.19 
 
 
459 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  34.03 
 
 
446 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
505 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
505 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.24 
 
 
526 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  35.97 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  36.2 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  36.28 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
531 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  38.94 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  41.32 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
517 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.06 
 
 
492 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
515 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  39.94 
 
 
523 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.23 
 
 
515 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  36.8 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>