More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0228 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  363  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  83.93 
 
 
176 aa  292  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  83.33 
 
 
176 aa  289  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  77.51 
 
 
194 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  79.39 
 
 
178 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  79.39 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  76.33 
 
 
178 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  76.19 
 
 
178 aa  258  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  78.18 
 
 
179 aa  256  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  75.72 
 
 
178 aa  256  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  75.14 
 
 
178 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  75.14 
 
 
178 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  65.71 
 
 
185 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  70.7 
 
 
186 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  65.87 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  67.31 
 
 
213 aa  225  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  71.53 
 
 
178 aa  221  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  61.15 
 
 
174 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 
171 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
168 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  59.03 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  56.62 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  53.79 
 
 
203 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  56.62 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  55.94 
 
 
166 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  59.4 
 
 
164 aa  173  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  49.67 
 
 
166 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  47.2 
 
 
167 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.41 
 
 
173 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  47.22 
 
 
165 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  40.91 
 
 
167 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.58 
 
 
171 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  31.55 
 
 
167 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  33.12 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 
173 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  35.37 
 
 
173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 
173 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  34.56 
 
 
169 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  34.36 
 
 
173 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  35.37 
 
 
173 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.97 
 
 
173 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  34.36 
 
 
173 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  30.36 
 
 
183 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  34.81 
 
 
173 aa  97.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  35.61 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  38.52 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  34.15 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  37.4 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.15 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.67 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  32.93 
 
 
164 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.97 
 
 
288 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  34.4 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  30.91 
 
 
433 aa  85.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 
184 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.59 
 
 
189 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.35 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  34.23 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  32.18 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.32 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.33 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  32.82 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  31.85 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  31.33 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  34.11 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  34.15 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  30.67 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  28.15 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  32.68 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  28.15 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  29.08 
 
 
248 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  35.9 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.39 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.2 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.6 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  31.25 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  32.35 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  32.06 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>