285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0216 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  80.78 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  79.22 
 
 		 241 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  73.71 
 
 		 252 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  74.49 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2888  lipoate-protein ligase B  72.8 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  72.8 
 
 		 251 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  74.78 
 
 		 255 aa  338  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2938  lipoate-protein ligase B  72.4 
 
 		 251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 257 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 254 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 246 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 252 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  76.28 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2800  lipoate-protein ligase B  73.2 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  77.52 
 
 		 248 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  73.02 
 
 		 236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  77.54 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  68.04 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  67.12 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  67.12 
 
 		 229 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  64.4 
 
 		 205 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  57.84 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  56.59 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0400  lipoate-protein ligase B  54.07 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  58.45 
 
 		 222 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  51.13 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  54.15 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  50.48 
 
 		 220 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  50.72 
 
 		 216 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  50.23 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  52.45 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  52.17 
 
 		 215 aa  215  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  54.55 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  54.55 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  54.55 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  51.89 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  51.6 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  52.45 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  54.01 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  54.01 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  51.6 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  50.45 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  53.14 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  47.39 
 
 		 235 aa  212  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  53.62 
 
 		 215 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  53.62 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  51.92 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  52.66 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  53.62 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  53.48 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  53.48 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  51.17 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  53.48 
 
 		 217 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  55.68 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  53.48 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  51.87 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  53 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  52.29 
 
 		 216 aa  208  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  50.96 
 
 		 207 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0411  lipoate-protein ligase B  47.81 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  48.82 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  48.6 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  46.64 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  51.56 
 
 		 216 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0650  lipoate-protein ligase B  49.29 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  54.21 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  52.88 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0363  lipoate-protein ligase B  48.66 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 218 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  43.06 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  50.5 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  49.05 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  45.89 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  52.02 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  51.9 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  45.89 
 
 		 219 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  48.31 
 
 		 218 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  47.37 
 
 		 212 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  43.06 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0471  lipoate-protein ligase B  47.77 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  52.86 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0314  lipoate-protein ligase B  43.8 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>