188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0163 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  70.49 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  73.58 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  64.81 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  50.75 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  53.03 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  59.02 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  56.92 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.36 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  55.93 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  60 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  56 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  51.52 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  55.36 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.46 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  60.78 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  60.78 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  54.72 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.48 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  57.14 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  57.69 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  48.98 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  51.92 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  48.33 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  53.7 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  57.69 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  48.21 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  49.06 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  49.06 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  47.92 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  49.06 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40.62 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40.3 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  52.08 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  44.44 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  41.82 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  45.1 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  36.07 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  42 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  37.29 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  39.06 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  39.68 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  38.3 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  54.76 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  59.46 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  45.1 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  42 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  34.48 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  54.76 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  39.62 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  36.67 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  54.76 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  54.76 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  38.3 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  43.18 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  39.34 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  54.76 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  45.83 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  51.16 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  52.38 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  54.76 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  54.76 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  54.76 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  52.38 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  48.89 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  44.19 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  44.19 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  37.29 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  44.19 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  47.62 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  44.19 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  39.66 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>