More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0098 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 		 288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  62.92 
 
 		 292 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  55.31 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  51.19 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  56.49 
 
 		 271 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  56.49 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  54.82 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  55.46 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  53.28 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  54.98 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  59.79 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 479 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.27 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.85 
 
 		 388 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.42 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.43 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 370 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  31.78 
 
 		 493 aa  99  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 552 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 801 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 799 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 700 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 		 680 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 		 680 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  30.52 
 
 		 619 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 385 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32.46 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 703 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 748 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  30.99 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  33.64 
 
 		 394 aa  95.9  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 		 495 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.64 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  32.37 
 
 		 461 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 707 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  28.46 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 684 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 372 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 466 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 448 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 700 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 700 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 450 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3763  Histidine kinase  32.88 
 
 		 394 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.597205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  29.36 
 
 		 687 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 385 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 1168 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  27.92 
 
 		 458 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  33 
 
 		 459 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 703 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 363 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 599 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 446 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  34.53 
 
 		 464 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 692 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 383 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.61 
 
 		 392 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 490 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  30.7 
 
 		 439 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  31.4 
 
 		 464 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 382 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 474 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  30.88 
 
 		 671 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 490 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  30.09 
 
 		 799 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 784 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  29.91 
 
 		 830 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 688 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 671 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  30.56 
 
 		 393 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 665 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  34.06 
 
 		 500 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  34.06 
 
 		 500 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  34.06 
 
 		 500 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 513 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  34.06 
 
 		 500 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  33.33 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 446 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  34.06 
 
 		 500 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  30.09 
 
 		 797 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 535 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 489 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  30.26 
 
 		 670 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.89 
 
 		 598 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 598 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 378 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  31.03 
 
 		 500 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  31.03 
 
 		 500 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.85 
 
 		 1809 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 497 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 500 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 497 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 501 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  31.03 
 
 		 497 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>