46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0085 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  64.37 
 
 		 1060 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  62.07 
 
 		 1060 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  45.05 
 
 		 1064 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  46.75 
 
 		 1058 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  44.83 
 
 		 1081 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1084 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  43.82 
 
 		 1057 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  46.59 
 
 		 1065 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  43.82 
 
 		 1076 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  43.82 
 
 		 1076 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.48 
 
 		 1056 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1084 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1084 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1084 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  41.18 
 
 		 1061 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1065 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1064 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  39.77 
 
 		 1072 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  41.98 
 
 		 1064 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 		 1078 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  42.86 
 
 		 1061 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  35.9 
 
 		 1064 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  39 
 
 		 1072 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  39 
 
 		 1072 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  36.67 
 
 		 1057 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  38.82 
 
 		 1082 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1082 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1055 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1055 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1068 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1068 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1082 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1082 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  37.21 
 
 		 1063 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 		 1057 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  37.63 
 
 		 1055 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  36.56 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  36.56 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  34.09 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1072 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  40.22 
 
 		 1065 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 1462 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>