More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0035 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  90.42 
 
 		 167 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  89.82 
 
 		 167 aa  316  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  86.83 
 
 		 167 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  86.23 
 
 		 167 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  86.23 
 
 		 167 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  85.63 
 
 		 181 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  86.23 
 
 		 167 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  85.63 
 
 		 167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  85.63 
 
 		 167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  82.04 
 
 		 179 aa  295  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  81.44 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  81.44 
 
 		 179 aa  291  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  81.44 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  81.44 
 
 		 167 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  81.44 
 
 		 179 aa  290  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  81.44 
 
 		 179 aa  290  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  81.44 
 
 		 167 aa  290  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  82.1 
 
 		 171 aa  277  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  81.48 
 
 		 171 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  80.25 
 
 		 169 aa  273  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  74.7 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  74.07 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  70.99 
 
 		 171 aa  243  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  70.12 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  67.28 
 
 		 169 aa  234  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  70.12 
 
 		 167 aa  233  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  67.07 
 
 		 171 aa  233  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  67.9 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  69.14 
 
 		 170 aa  227  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  67.28 
 
 		 167 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  66.67 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  62.5 
 
 		 170 aa  220  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  64.2 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  64.2 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  64.2 
 
 		 173 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  62.96 
 
 		 171 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  62.96 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  61.73 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  65.85 
 
 		 167 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  60.49 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  61.73 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  59.88 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  62.96 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  61.11 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  59.26 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  58.64 
 
 		 168 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  59.39 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  58.02 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  58.02 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  58.02 
 
 		 168 aa  203  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  66.05 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  61.11 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  60.12 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  60.12 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  58.54 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  56.79 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  200  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  59.51 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  56.71 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  56.71 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  56.71 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  57.67 
 
 		 169 aa  193  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  57.41 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  58.64 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  56.1 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  55.49 
 
 		 169 aa  190  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  55.56 
 
 		 176 aa  190  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  54.6 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  57.49 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  62.8 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  55.21 
 
 		 184 aa  188  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  58.23 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  53.99 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  54.27 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  53.99 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  54.6 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  52.69 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  54.6 
 
 		 172 aa  183  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  54.88 
 
 		 178 aa  183  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  52.12 
 
 		 167 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  53.05 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  55.83 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0024  peptide deformylase  54.27 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  55.56 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  53.05 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  51.22 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  53.05 
 
 		 168 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  53.05 
 
 		 168 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>