36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0005 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0012  tRNA-Met  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000647679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0043  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0048  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0024  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0026  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000311751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0014  tRNA-Met  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000605229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0001  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0008  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229004  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0054  tRNA-Met  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0030  tRNA-Met  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00179539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>