More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2761 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
468 aa  939    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  23.7 
 
 
457 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  21.43 
 
 
446 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
643 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
4079 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
402 aa  67  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.44 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
1276 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 
638 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
992 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
927 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.45 
 
 
730 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 
689 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  23.64 
 
 
614 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
311 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
311 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1297 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
393 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
711 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
750 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.43 
 
 
725 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.34 
 
 
820 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
748 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
3560 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.45 
 
 
733 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  23.76 
 
 
379 aa  60.1  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
699 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  20.43 
 
 
561 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
3035 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  20.43 
 
 
561 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
592 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1771  Tetratricopeptide TPR_4  22.14 
 
 
339 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
893 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
716 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  21.31 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
201 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
245 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 
1694 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 
593 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  20.81 
 
 
520 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
632 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
624 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.02 
 
 
837 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
375 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  25 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 
1069 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  18.72 
 
 
1737 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.18 
 
 
1676 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
518 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
399 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.19 
 
 
988 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
573 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 
639 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
544 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
617 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
416 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
265 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 
557 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
597 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.34 
 
 
1022 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
522 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
842 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.81 
 
 
676 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.38 
 
 
887 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.65 
 
 
738 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2735  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00105552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.88 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25 
 
 
681 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  20.35 
 
 
955 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
291 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  24.53 
 
 
583 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.36 
 
 
1979 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
309 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 
208 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.16 
 
 
2240 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
792 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 
566 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
258 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 
292 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 
592 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 
883 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.59 
 
 
340 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 
594 aa  53.5  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
673 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>