More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2733 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  66.38 
 
 
291 aa  335  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  65.49 
 
 
235 aa  314  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  63.25 
 
 
233 aa  314  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  64.73 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  64.6 
 
 
235 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  61.06 
 
 
238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  59.73 
 
 
281 aa  305  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  61.95 
 
 
232 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  60.62 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0123  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  58.82 
 
 
252 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  62.44 
 
 
248 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  60.62 
 
 
244 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  57.81 
 
 
257 aa  298  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  62.95 
 
 
267 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  60.71 
 
 
280 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  59.83 
 
 
233 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  58.13 
 
 
244 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  59.83 
 
 
233 aa  295  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  59.83 
 
 
233 aa  295  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  58.66 
 
 
257 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  295  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  59.4 
 
 
233 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  61.61 
 
 
251 aa  292  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  58.68 
 
 
257 aa  292  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  57.26 
 
 
343 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  57.26 
 
 
314 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  56.59 
 
 
246 aa  291  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  57.49 
 
 
301 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  58.85 
 
 
236 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 
256 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  58.41 
 
 
232 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  52.22 
 
 
272 aa  288  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  57.39 
 
 
282 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  58.3 
 
 
263 aa  288  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  57.26 
 
 
262 aa  288  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  56.85 
 
 
315 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  56.09 
 
 
284 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  51.85 
 
 
289 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  56.09 
 
 
284 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  56.09 
 
 
284 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  62.05 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  56.81 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 
255 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  59.03 
 
 
233 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  59.03 
 
 
233 aa  285  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  51.46 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  53.15 
 
 
255 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  52.24 
 
 
262 aa  285  7e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  53.15 
 
 
255 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 
273 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 
255 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  55.51 
 
 
271 aa  285  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  53.18 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  60 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  55.65 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  56.09 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  51.55 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.35 
 
 
279 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  52.14 
 
 
274 aa  281  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  56.1 
 
 
304 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  54.43 
 
 
247 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  59.29 
 
 
255 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  52.96 
 
 
258 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 
259 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  53.6 
 
 
262 aa  278  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  52.85 
 
 
300 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  53.88 
 
 
246 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  55.36 
 
 
296 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  56.25 
 
 
289 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  56.11 
 
 
303 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1316  30S ribosomal protein S2  51.88 
 
 
263 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.715024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1197  30S ribosomal protein S2  51.88 
 
 
263 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  56.36 
 
 
243 aa  275  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0547  30S ribosomal protein S2  51.5 
 
 
263 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1802  30S ribosomal protein S2  56.17 
 
 
259 aa  275  8e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0866848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  55.8 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  49.45 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1094  30S ribosomal protein S2  57.73 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.240704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  50.61 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002746  SSU ribosomal protein S2p (SAe)  57.39 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0133087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  52.69 
 
 
260 aa  272  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  56.11 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 
260 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  54.82 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  52.07 
 
 
267 aa  271  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  52.68 
 
 
304 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  54.59 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  51.98 
 
 
261 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  54.63 
 
 
241 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03237  30S ribosomal protein S2  56.39 
 
 
253 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  54.63 
 
 
241 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  54.63 
 
 
241 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>