168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2625 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  57.89 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  50.67 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  54.1 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  55.22 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  54.39 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  51.61 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  42.42 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  50.88 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  46.38 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  50.85 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  41.33 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  46.15 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  47.46 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  38.24 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  51.72 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  45.16 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.54 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  43.08 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  47.37 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  38.03 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  40.85 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  35.21 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  40.79 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  45.61 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  46.38 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  40.54 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  45.76 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  36.62 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  45.45 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  47.37 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  46.03 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  35.21 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  38.03 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  35.21 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  38.67 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  45.76 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0924  regulatory protein, FmdB family  44.78 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  41.33 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  37.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  38.27 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  45.61 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  44.62 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  44.26 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  38.89 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  40.3 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  38.89 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  44.07 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  35.29 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  43.86 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  35.29 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  36.23 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  36.23 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  37.5 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  46.55 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  42.62 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  34.78 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  45.76 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  39.71 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  33.85 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  35.38 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  41.54 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  35.06 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  39.71 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  33.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  33.85 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  39.71 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>