175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2585 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  100 
 
 
302 aa  584  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  55.63 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  55.2 
 
 
306 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
295 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51.81 
 
 
329 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  51.2 
 
 
298 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  50.18 
 
 
304 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  49.83 
 
 
315 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  50.17 
 
 
298 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  49.16 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  52.04 
 
 
309 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  50 
 
 
295 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  50.52 
 
 
295 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  50.67 
 
 
298 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  50.34 
 
 
298 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  50.85 
 
 
293 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  48.45 
 
 
303 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  49.66 
 
 
339 aa  242  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  50 
 
 
294 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  49.48 
 
 
302 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  49.48 
 
 
302 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.33 
 
 
336 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  49.33 
 
 
298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  48.89 
 
 
325 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  50.67 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  50.67 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  44.64 
 
 
298 aa  232  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  48.8 
 
 
300 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
330 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  45.45 
 
 
313 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  47.32 
 
 
312 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  45.95 
 
 
293 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  47.55 
 
 
299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  49.81 
 
 
308 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.97 
 
 
330 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.62 
 
 
289 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.16 
 
 
297 aa  222  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  45.35 
 
 
287 aa  222  7e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  43.88 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  49.14 
 
 
313 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
299 aa  218  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  47.75 
 
 
294 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  47.28 
 
 
296 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  48.08 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  47.92 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
294 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  44.7 
 
 
299 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  44.77 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.01 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  44.44 
 
 
303 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
299 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  46.34 
 
 
294 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  46.74 
 
 
292 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  42.95 
 
 
311 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  41.96 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  45.23 
 
 
640 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.06 
 
 
584 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  38.66 
 
 
365 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  45.61 
 
 
299 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  38.52 
 
 
305 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  38.52 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
300 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  35.57 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  36.8 
 
 
363 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
329 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  57.84 
 
 
120 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  28.73 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.47 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  27.11 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  27.04 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  28.65 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  26.77 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.86 
 
 
314 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  28.65 
 
 
351 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  28.65 
 
 
351 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.55 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  25.21 
 
 
339 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  30.69 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  26.43 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  25.76 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  24.28 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  25.96 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  25.96 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  25.96 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  26.87 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>