143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2547 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  100 
 
 		 1076 aa  2175    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1154 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1209 aa  538  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  30.89 
 
 		 1132 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1177 aa  459  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1338 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1120 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1039 aa  349  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1147 aa  310  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  29.37 
 
 		 1257 aa  268  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.05 
 
 		 1244 aa  268  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.29 
 
 		 995 aa  267  8.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  38.9 
 
 		 1159 aa  264  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1036 aa  260  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1178 aa  235  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.44 
 
 		 1170 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1299 aa  218  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1426 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  28.75 
 
 		 1089 aa  182  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  25.32 
 
 		 1252 aa  169  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.89 
 
 		 974 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  24.53 
 
 		 1256 aa  160  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1210 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1298 aa  139  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1612 aa  131  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.49 
 
 		 410 aa  128  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.37 
 
 		 950 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1184 aa  124  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.48 
 
 		 1020 aa  124  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1104 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  23.76 
 
 		 518 aa  121  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.26 
 
 		 1194 aa  118  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  36.71 
 
 		 247 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  22 
 
 		 562 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  21.34 
 
 		 557 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.75 
 
 		 1432 aa  101  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  26.77 
 
 		 570 aa  99  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.22 
 
 		 1058 aa  95.1  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.2 
 
 		 836 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  21.83 
 
 		 629 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1338 aa  87  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  27.19 
 
 		 1186 aa  85.9  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  20.64 
 
 		 882 aa  82.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.55 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1125 aa  76.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1088 aa  75.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1339 aa  75.1  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  22.77 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  23.43 
 
 		 1041 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  21.83 
 
 		 1343 aa  72  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  18.93 
 
 		 1346 aa  71.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.77 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  19.84 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.56 
 
 		 1319 aa  67.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1422 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.94 
 
 		 838 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  19.07 
 
 		 1209 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1459 aa  65.1  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  22.08 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1243 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  20.03 
 
 		 1231 aa  63.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  25.31 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  35.56 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  21.16 
 
 		 1180 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1373 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1324 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1182 aa  60.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  23.53 
 
 		 1306 aa  59.7  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  19.05 
 
 		 1282 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  31.82 
 
 		 1285 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23 
 
 		 1278 aa  59.3  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  21.35 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  20.82 
 
 		 1205 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.13 
 
 		 1241 aa  58.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.41 
 
 		 1277 aa  58.2  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  22.71 
 
 		 1055 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1497 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  19.69 
 
 		 1365 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1425 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  26.84 
 
 		 1322 aa  56.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1250 aa  55.8  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1363 aa  55.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  20.27 
 
 		 1322 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  23.94 
 
 		 925 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1452 aa  55.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  24.62 
 
 		 919 aa  55.1  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  23.03 
 
 		 1219 aa  54.7  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1250 aa  55.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1173 aa  54.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.18 
 
 		 522 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  30.47 
 
 		 504 aa  53.5  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.51 
 
 		 1358 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  23.49 
 
 		 792 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 694 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  24.65 
 
 		 423 aa  52.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  18.61 
 
 		 1231 aa  51.6  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.67 
 
 		 1338 aa  51.6  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  21.67 
 
 		 612 aa  51.6  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.29 
 
 		 524 aa  51.6  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.53 
 
 		 1002 aa  51.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>