More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2538 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
481 aa  996    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
485 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
485 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
485 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
486 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
488 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
478 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
491 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
490 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
491 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
491 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
488 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
480 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
491 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
479 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
485 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
484 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
484 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.58 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
469 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
492 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
469 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
491 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
469 aa  392  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
494 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
504 aa  383  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
496 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
488 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
465 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
480 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
488 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
466 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
467 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
501 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
499 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
469 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
495 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
498 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  41.77 
 
 
546 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
492 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
466 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.85 
 
 
518 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
466 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
471 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
463 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
535 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
484 aa  359  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
467 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
484 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
467 aa  357  3.9999999999999996e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
467 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
466 aa  355  7.999999999999999e-97  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
509 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
474 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
474 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
474 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
472 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
482 aa  351  2e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
464 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  37.9 
 
 
588 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
468 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
881 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
469 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
481 aa  350  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
500 aa  350  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
475 aa  349  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
471 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
471 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
467 aa  349  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
475 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
472 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
504 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
464 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
464 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
471 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
471 aa  346  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
481 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  346  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
464 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
483 aa  345  1e-93  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
471 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
469 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>