More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2504 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
669 aa  1376    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.29 
 
 
639 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  35.8 
 
 
617 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
643 aa  363  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
645 aa  351  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 
574 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.59 
 
 
801 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
636 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
766 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
801 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 
801 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 
793 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.2 
 
 
647 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.03 
 
 
645 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 
678 aa  333  6e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
671 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
618 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 
640 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 
610 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 
609 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
618 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
618 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 
618 aa  323  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.65 
 
 
631 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
630 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
618 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
655 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 
641 aa  320  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
640 aa  320  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.13 
 
 
646 aa  319  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.48 
 
 
629 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
618 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.96 
 
 
618 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  34.8 
 
 
800 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
618 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
618 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
618 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  33.12 
 
 
637 aa  317  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  317  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  317  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
633 aa  317  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 
633 aa  317  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 
643 aa  317  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 
642 aa  316  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 
633 aa  316  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.96 
 
 
771 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 
631 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 
629 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 
629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 
767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
664 aa  314  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.55 
 
 
802 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
629 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 
662 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
646 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 
655 aa  313  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.47 
 
 
775 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
765 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  34.53 
 
 
756 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
765 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  34.53 
 
 
760 aa  312  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.34 
 
 
803 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.8 
 
 
638 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
764 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  34.34 
 
 
809 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  34.19 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
627 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
761 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 
610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
586 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  33.45 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.5 
 
 
631 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
636 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.97 
 
 
803 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 
646 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  31.87 
 
 
631 aa  306  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  32.28 
 
 
634 aa  306  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
618 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  33.23 
 
 
634 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>