More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2378 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  60.43 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  60.43 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  60.43 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  50 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  34.03 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  36.18 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.1 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.53 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 201 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  39.01 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  36.92 
 
 		 166 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  35.17 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  40.37 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  34.71 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  40.37 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  32.08 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  30.25 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  29.63 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.11 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  34.04 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  38.53 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  40.37 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  38.68 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  36.43 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  39.64 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.05 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  38.26 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  39.64 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  38.26 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  35.65 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  34.27 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  34 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  36.21 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>