More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2148 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2148  pseudouridine synthase  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  36 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  42.2 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  37.62 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  38.99 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  37.44 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  37.32 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  36.36 
 
 		 306 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  35.44 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1281  pseudouridine synthase  31.4 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.33 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  36.28 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  33.62 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  33.77 
 
 		 318 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.56 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  37.21 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  37.28 
 
 		 322 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  33.62 
 
 		 313 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  33.99 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  37.25 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1692  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.88 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  33.33 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3988  pseudouridine synthase  29.95 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.65 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1383  pseudouridine synthase, RluA family  33.17 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  36.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  32.54 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.68 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.88 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0462638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  34 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  34.96 
 
 		 326 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.82 
 
 		 321 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.96 
 
 		 308 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1323  pseudouridine synthase  29.95 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  34 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  30.26 
 
 		 329 aa  124  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 551 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  32.23 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3138  pseudouridine synthase  33.65 
 
 		 549 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  34.13 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  36.5 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1610  pseudouridine synthase  32.04 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911925  normal  0.237577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  33.97 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0655  pseudouridine synthase  32.5 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  33.48 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.27 
 
 		 296 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  32.23 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  33.5 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  34.01 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.4 
 
 		 304 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.4 
 
 		 304 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.4 
 
 		 304 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  32.23 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  31.76 
 
 		 352 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1405  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.91 
 
 		 307 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  32.52 
 
 		 551 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1022  RluA family pseudouridine synthase  30.9 
 
 		 324 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000246501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1875  RluA family pseudouridine synthase  30.84 
 
 		 317 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.763374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1446  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  34.91 
 
 		 307 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  31.7 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  30.47 
 
 		 315 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  31.33 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2087  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  29.95 
 
 		 245 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000349962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0567  pseudouridine synthase  36.5 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  31.53 
 
 		 330 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1208  RluA family pseudouridine synthase  34.43 
 
 		 307 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  30.28 
 
 		 331 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.68 
 
 		 307 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  30.28 
 
 		 327 aa  121  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.19 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1184  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase D  35.68 
 
 		 307 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3230  RluA family pseudouridine synthase  33.65 
 
 		 320 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  31.28 
 
 		 309 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1374  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.62 
 
 		 543 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  33.65 
 
 		 339 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1232  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  29.13 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2605  pseudouridylate synthase  30.47 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000283334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.5 
 
 		 296 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2380  pseudouridine synthase  29.52 
 
 		 238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  34.48 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.1 
 
 		 331 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3831  pseudouridylate synthase  27.94 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.33 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  33.04 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35140  Pseudouridylate synthase RluA  29.76 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1123  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.84 
 
 		 309 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.095131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  33.96 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.9 
 
 		 323 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000045802  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3074  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.9 
 
 		 323 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000195279  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3171  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.9 
 
 		 323 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000261033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  38.32 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  34.33 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  31.78 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.55 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  32 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1632  pseudouridine synthase, RluA family  31.82 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  32.57 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  32.39 
 
 		 329 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  31.97 
 
 		 343 aa  118  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>