More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2043 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
231 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 
232 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
245 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
240 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 
228 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
237 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
238 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 
277 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 
228 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 
234 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 
228 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
228 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 
228 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
230 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
228 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
255 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
265 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
255 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
238 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  27.4 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  25.85 
 
 
231 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
238 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.61 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 
240 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
261 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  20.49 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
219 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 
265 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  25.26 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  25.13 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>