More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2023 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
531 aa  1088    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  50.56 
 
 
533 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  50.28 
 
 
534 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  48.69 
 
 
534 aa  523  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  47.1 
 
 
535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  49.54 
 
 
537 aa  500  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  49.23 
 
 
530 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  46.43 
 
 
542 aa  491  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  47 
 
 
534 aa  489  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  47.66 
 
 
536 aa  484  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  47.88 
 
 
535 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  46.44 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  42.62 
 
 
544 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  42 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  41.48 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  40.04 
 
 
535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  40.74 
 
 
538 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  42.58 
 
 
535 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  37.18 
 
 
552 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 
545 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 
541 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 
536 aa  300  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
550 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
544 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.38 
 
 
543 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  32.66 
 
 
535 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  34.9 
 
 
547 aa  279  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  34.02 
 
 
555 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 
556 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
556 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
545 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 
530 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  32.7 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
544 aa  274  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 
533 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 
539 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  35.7 
 
 
526 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.13 
 
 
537 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  31.66 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
543 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 
530 aa  269  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  34.29 
 
 
544 aa  269  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
543 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  34.42 
 
 
545 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  34.04 
 
 
526 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
558 aa  267  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  31.26 
 
 
558 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
525 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
526 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  35.03 
 
 
545 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.47 
 
 
543 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
545 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  32.79 
 
 
543 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.47 
 
 
543 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
528 aa  265  1e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
534 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
532 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.47 
 
 
543 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.13 
 
 
536 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 
528 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
534 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.47 
 
 
543 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
549 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.02 
 
 
543 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  33.06 
 
 
529 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
544 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
529 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.98 
 
 
525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
529 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.85 
 
 
525 aa  259  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  31.83 
 
 
543 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 
558 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 
558 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.83 
 
 
543 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
528 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.83 
 
 
558 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.83 
 
 
543 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  31.83 
 
 
543 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
561 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
545 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.13 
 
 
545 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 
549 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.13 
 
 
525 aa  257  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.83 
 
 
558 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.04 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  32.28 
 
 
530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 
538 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
545 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.04 
 
 
536 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  32.54 
 
 
538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 
538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  32.54 
 
 
538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.32 
 
 
532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  32.63 
 
 
537 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  32.76 
 
 
537 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  32.76 
 
 
537 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
537 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>