More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1991 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  51.5 
 
 
206 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  49.51 
 
 
253 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.75 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.57 
 
 
250 aa  188  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.48 
 
 
211 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  52.53 
 
 
256 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  47.52 
 
 
255 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  47.55 
 
 
253 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.37 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.67 
 
 
219 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  46.01 
 
 
211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46.57 
 
 
256 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.31 
 
 
255 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.21 
 
 
259 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.45 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.74 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  48.37 
 
 
257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.24 
 
 
257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.12 
 
 
230 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  42 
 
 
224 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.91 
 
 
256 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  39.44 
 
 
227 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.26 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  46 
 
 
255 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.96 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  45.1 
 
 
260 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  42.23 
 
 
210 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  44.95 
 
 
208 aa  158  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  46.5 
 
 
254 aa  158  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  41.28 
 
 
208 aa  158  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  44.29 
 
 
216 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  46.6 
 
 
258 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.5 
 
 
240 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  42.78 
 
 
235 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.78 
 
 
207 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  39.27 
 
 
209 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  39.27 
 
 
209 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.03 
 
 
202 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  43.28 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.03 
 
 
202 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  40.49 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.41 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  42.08 
 
 
207 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  46.84 
 
 
255 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  43.62 
 
 
209 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  46.84 
 
 
255 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  42.42 
 
 
212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.64 
 
 
206 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  41.45 
 
 
207 aa  151  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  41.05 
 
 
248 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  39.05 
 
 
219 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  42.73 
 
 
230 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  40.89 
 
 
209 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  42.25 
 
 
206 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  45.08 
 
 
203 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  41.05 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  41.24 
 
 
240 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  40 
 
 
198 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  42.41 
 
 
238 aa  148  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  42.41 
 
 
238 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  38.94 
 
 
217 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  41.8 
 
 
225 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  42.27 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  41.38 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  42.11 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  37.21 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  40.67 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  37.38 
 
 
338 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  39.49 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  41.83 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  36.28 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.04 
 
 
268 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  44.22 
 
 
208 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  44.21 
 
 
203 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  38.94 
 
 
206 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.98 
 
 
198 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.98 
 
 
198 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.98 
 
 
198 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  42.35 
 
 
197 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  42.42 
 
 
206 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.98 
 
 
198 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.98 
 
 
198 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  43.16 
 
 
208 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  40.09 
 
 
220 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  40.09 
 
 
220 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  35.81 
 
 
283 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  42.86 
 
 
199 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  42.19 
 
 
211 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  39.58 
 
 
221 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  40 
 
 
236 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  44.21 
 
 
198 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  44.23 
 
 
210 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  44.21 
 
 
198 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>