More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1856 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
446 aa  893  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.53 
 
 
445 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.09 
 
 
437 aa  417  1e-115  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.43 
 
 
435 aa  416  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 
420 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
435 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 
447 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
435 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 
435 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  49.11 
 
 
424 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.32 
 
 
447 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
435 aa  405  1e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  51.14 
 
 
419 aa  405  1e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  47.05 
 
 
429 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  49.32 
 
 
447 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
435 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  46.05 
 
 
443 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.19 
 
 
442 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.88 
 
 
435 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.02 
 
 
463 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  48.08 
 
 
421 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 
443 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 
435 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  44.62 
 
 
443 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
443 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 
419 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 
449 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.97 
 
 
437 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 
444 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 
443 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  46.71 
 
 
426 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.61 
 
 
427 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  3.95879e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 
444 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  46.7 
 
 
447 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
438 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  2.40861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 
446 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45.41 
 
 
448 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.76 
 
 
421 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  45.87 
 
 
434 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.05 
 
 
418 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 
437 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 
437 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  45.1 
 
 
443 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  44.95 
 
 
443 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 
441 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  47.11 
 
 
446 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  45.33 
 
 
445 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  43.85 
 
 
443 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  47.59 
 
 
429 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  46.14 
 
 
442 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 
443 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  46.49 
 
 
446 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
443 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 
446 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 
439 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  43.36 
 
 
441 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 
457 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 
440 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 
436 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 
439 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 
446 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 
439 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  46.01 
 
 
445 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 
446 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 
443 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
442 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 
446 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  47.11 
 
 
446 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.47 
 
 
438 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  43.62 
 
 
437 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
442 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.38517e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 
446 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 
453 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  46.71 
 
 
446 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 
444 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0389  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 
444 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0414  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 
444 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  44.58 
 
 
439 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.84 
 
 
446 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  44.31 
 
 
437 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  44.42 
 
 
448 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 
441 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.25785e-06  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 
446 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  45.77 
 
 
439 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  43.51 
 
 
444 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
443 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 
437 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
442 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 
444 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  46.83 
 
 
431 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  44.82 
 
 
454 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 
443 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 
452 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
443 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
443 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 
443 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 
452 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 
446 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.44124e-08  unclonable  3.04117e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 
446 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.2283e-06  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  44.84 
 
 
444 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>