More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1853 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  100 
 
 
172 aa  345  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  63.46 
 
 
166 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.73 
 
 
166 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  208  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  205  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
166 aa  204  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.1 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  61.69 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  61.04 
 
 
167 aa  193  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  53.18 
 
 
173 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.52 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.21 
 
 
197 aa  188  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.17 
 
 
164 aa  187  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
167 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  52.02 
 
 
175 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
168 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 
166 aa  185  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
165 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
165 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
167 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 
162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  56.95 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  56.95 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  54.09 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  56.97 
 
 
169 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  53.75 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  57.14 
 
 
168 aa  180  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.08 
 
 
182 aa  180  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  52.76 
 
 
166 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  54.25 
 
 
173 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  60.69 
 
 
147 aa  179  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  53.37 
 
 
166 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  52.5 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  54.04 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  52.5 
 
 
199 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  50.3 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 
171 aa  177  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 
171 aa  177  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 
236 aa  177  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 
202 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
162 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
162 aa  177  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  51.48 
 
 
169 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  50 
 
 
165 aa  176  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  51.95 
 
 
169 aa  176  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
162 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 
202 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 
147 aa  175  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 
208 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 
162 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  52.53 
 
 
238 aa  174  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  52.87 
 
 
183 aa  174  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
162 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  52.07 
 
 
168 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
166 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
163 aa  174  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
166 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
166 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
166 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  57.53 
 
 
147 aa  174  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 
166 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 
162 aa  173  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  49.69 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  57.53 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  54.84 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 
167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  51.55 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  51.55 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  51.55 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  51.55 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>