More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1837 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  45.02 
 
 
209 aa  180  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  46.63 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 
207 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 
206 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  45.19 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.23 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 
207 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  41.95 
 
 
207 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  42.31 
 
 
206 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 
207 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 
207 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.9 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 
207 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  39.72 
 
 
222 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.41 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  39.9 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  39.53 
 
 
221 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 
206 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 
207 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 
208 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  42.92 
 
 
210 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  40.28 
 
 
292 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  43.72 
 
 
219 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 
214 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  41.35 
 
 
223 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 
208 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  37.32 
 
 
223 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 
204 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  40.85 
 
 
208 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  39.62 
 
 
210 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
219 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
219 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 
212 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39.05 
 
 
223 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  39.9 
 
 
207 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
219 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  41.9 
 
 
215 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 
210 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 
221 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 
204 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  39.52 
 
 
214 aa  155  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
206 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  39.05 
 
 
205 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  40.49 
 
 
210 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  40.2 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 
216 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  38.65 
 
 
209 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  40.87 
 
 
248 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  40.37 
 
 
221 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 
207 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  38.97 
 
 
210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  39.72 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 
208 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 
210 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0588  ribosomal protein L4/L1e  43.06 
 
 
228 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290054  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6613  ribosomal protein L4/L1e  40.98 
 
 
231 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  39.23 
 
 
228 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  39.13 
 
 
234 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  41.58 
 
 
207 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  40.8 
 
 
206 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  38.46 
 
 
209 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 
208 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  39.27 
 
 
223 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  40.3 
 
 
206 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  39.15 
 
 
234 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  40.48 
 
 
209 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
208 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  39.05 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  40.74 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  38.71 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  35.1 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  39.3 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 
205 aa  146  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  40.2 
 
 
220 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  38.12 
 
 
215 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>