195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1639 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  100 
 
 
803 aa  1639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
842 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  31.54 
 
 
836 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  32.54 
 
 
842 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
828 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  32.55 
 
 
828 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
812 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 
826 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  39.16 
 
 
628 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  39.15 
 
 
626 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 
828 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 
657 aa  419  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 
599 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 
599 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 
619 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
617 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 
817 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 
897 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 
624 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  35.43 
 
 
618 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  35.79 
 
 
613 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
611 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  30.56 
 
 
898 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  36.61 
 
 
638 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 
619 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  34.78 
 
 
636 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.19 
 
 
860 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 
645 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 
640 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  30.01 
 
 
898 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 
610 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 
653 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 
617 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 
617 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
849 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 
654 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 
627 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 
655 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  30.01 
 
 
898 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  34.45 
 
 
626 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 
633 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.89 
 
 
644 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
614 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 
613 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  32.99 
 
 
842 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
642 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 
640 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
864 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  32.03 
 
 
626 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 
621 aa  372  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  29.4 
 
 
897 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
663 aa  365  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 
597 aa  364  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 
677 aa  364  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 
645 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  34.35 
 
 
922 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  32.28 
 
 
679 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 
663 aa  361  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
681 aa  359  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 
852 aa  356  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
661 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
600 aa  355  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 
600 aa  351  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  31.29 
 
 
626 aa  351  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  29.82 
 
 
879 aa  350  8e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 
591 aa  350  8e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.37 
 
 
887 aa  348  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.46 
 
 
894 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  32.87 
 
 
971 aa  346  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 
860 aa  344  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.1 
 
 
872 aa  337  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
856 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
857 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  28.83 
 
 
882 aa  330  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
874 aa  330  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  28.78 
 
 
910 aa  328  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  27.5 
 
 
898 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 
613 aa  230  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 
551 aa  209  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 
566 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
589 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 
593 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
589 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  25.5 
 
 
589 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 
544 aa  202  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  28.29 
 
 
559 aa  198  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  27.37 
 
 
573 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
544 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  26.67 
 
 
557 aa  177  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  25.83 
 
 
510 aa  172  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 
553 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 
557 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
545 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.64 
 
 
546 aa  157  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  26.89 
 
 
540 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
519 aa  157  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
438 aa  156  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>