19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1394 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1394  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.138559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1611  hypothetical protein  29.22 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1313  hypothetical protein  31.82 
 
 
168 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000209173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0082  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1017  hypothetical protein  29.92 
 
 
159 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.276388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1391  hypothetical protein  26.52 
 
 
160 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1270  hypothetical protein  26.96 
 
 
160 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0254283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14820  yjeF-like protein  24.81 
 
 
447 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0790751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2204  hypothetical protein  25.4 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2486  G/U mismatch-specific uracil-DNA glycosylase  27.68 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0471  hypothetical protein  25.93 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0142072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0852  Uracil-DNA glycosylase superfamily  24.26 
 
 
167 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0607293  normal  0.83582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2505  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.72 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.635116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2312  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3216  hypothetical protein  23.26 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2433  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00350669  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11950  G:T/U mismatch-specific DNA glycosylase  27 
 
 
172 aa  42  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.969798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1172  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.41 
 
 
168 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0989  hypothetical protein  26.97 
 
 
160 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>