More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1175 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
520 aa  1061  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.4 
 
 
579 aa  321  2e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.98 
 
 
602 aa  308  1e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.62 
 
 
551 aa  308  2e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.59 
 
 
632 aa  304  3e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.67 
 
 
582 aa  303  7e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.82 
 
 
518 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.96 
 
 
569 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.62 
 
 
579 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.95 
 
 
567 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.34 
 
 
582 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  32.25 
 
 
579 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.84 
 
 
682 aa  296  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.18 
 
 
649 aa  293  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  36.87 
 
 
652 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.37 
 
 
663 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  38.7 
 
 
614 aa  286  6e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.65 
 
 
582 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.57 
 
 
589 aa  283  4e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.17 
 
 
496 aa  283  4e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
565 aa  283  5e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.22 
 
 
735 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.89 
 
 
550 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 
625 aa  279  8e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.6 
 
 
527 aa  279  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.16 
 
 
732 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.82 
 
 
570 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.31282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.76 
 
 
534 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.84 
 
 
589 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  39.41 
 
 
650 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.05 
 
 
562 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.77 
 
 
562 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.32 
 
 
560 aa  276  7e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
955 aa  275  1e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  9.46714e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.05 
 
 
562 aa  275  1e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.38 
 
 
900 aa  274  2e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.37 
 
 
401 aa  275  2e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.33 
 
 
562 aa  273  5e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.22 
 
 
588 aa  273  5e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 
696 aa  273  5e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.24921e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.91 
 
 
723 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.44 
 
 
582 aa  272  8e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.05 
 
 
562 aa  272  8e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  36.11 
 
 
572 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  4.63974e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.33 
 
 
398 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.29 
 
 
591 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.5 
 
 
599 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.85 
 
 
604 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.44 
 
 
612 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.78 
 
 
634 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  38.16 
 
 
796 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.97 
 
 
688 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.56 
 
 
691 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.56 
 
 
692 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.74 
 
 
681 aa  270  6e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 
396 aa  270  6e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.76 
 
 
696 aa  269  9e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  34.8 
 
 
565 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  42.09 
 
 
559 aa  269  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.03 
 
 
689 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.41 
 
 
562 aa  269  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  39.26 
 
 
577 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.59 
 
 
732 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.29 
 
 
687 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.68 
 
 
622 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.66 
 
 
743 aa  267  3e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.41 
 
 
751 aa  268  3e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.25473e-05  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.66 
 
 
736 aa  268  3e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.63 
 
 
397 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
715 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.11 
 
 
863 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.55 
 
 
565 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.55 
 
 
565 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.52 
 
 
501 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.14 
 
 
701 aa  266  9e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.09 
 
 
570 aa  266  9e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.65 
 
 
730 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  37.9 
 
 
807 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.97 
 
 
690 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.44 
 
 
568 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.22 
 
 
427 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.99 
 
 
712 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.95 
 
 
559 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.88 
 
 
685 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.3 
 
 
582 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.88 
 
 
518 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.47 
 
 
561 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.85 
 
 
1113 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.07 
 
 
743 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.72 
 
 
614 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.6 
 
 
565 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.79 
 
 
573 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.6 
 
 
729 aa  263  7e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.29 
 
 
948 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66847e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>