More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1118 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
876 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
876 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
863 aa  655    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
876 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
876 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
880 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
878 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
881 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
883 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
863 aa  661    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
880 aa  647    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
880 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
877 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
878 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1118  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
857 aa  1762    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
879 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
878 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
875 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
874 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
874 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
879 aa  632  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39 
 
 
874 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
860 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
880 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
865 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
876 aa  628  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
875 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
874 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
874 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
879 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
874 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
897 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
876 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
874 aa  625  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
874 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
879 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
897 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
860 aa  621  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
897 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
884 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
879 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
892 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
870 aa  614  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
885 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
879 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
874 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
882 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
859 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
875 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
863 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
903 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
876 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  602  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
876 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  39 
 
 
882 aa  602  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
872 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
876 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
878 aa  599  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
876 aa  602  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
879 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
878 aa  602  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 
867 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
888 aa  602  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  38.46 
 
 
876 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
874 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
876 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  38 
 
 
876 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
874 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  38 
 
 
876 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
931 aa  595  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
876 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
876 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
869 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
888 aa  594  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
901 aa  592  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
874 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
860 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
878 aa  590  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
889 aa  591  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
864 aa  589  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
905 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
875 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
890 aa  592  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
865 aa  591  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
865 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
878 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
865 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>