More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0890 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
412 aa  809    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  55.33 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  53.52 
 
 
408 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  49.48 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  46.84 
 
 
399 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  48.99 
 
 
401 aa  326  6e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  42.6 
 
 
392 aa  316  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  42.32 
 
 
400 aa  292  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  42.41 
 
 
400 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 
413 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.17 
 
 
406 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  39.7 
 
 
433 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  41.62 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.75 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 
401 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  31.98 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 
391 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  34.21 
 
 
397 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.62 
 
 
387 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.21 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  26.65 
 
 
442 aa  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.95 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  26.34 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  27.7 
 
 
437 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  28.99 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  27.41 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  27.79 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  27.07 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.45 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  26.62 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  27.27 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.76 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.09 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  24.36 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  28.77 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.06 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  24.53 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  30.17 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  25.82 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  26.21 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  26.26 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  28.17 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  28.02 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  28.18 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.62 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  26.39 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  27.23 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  24.94 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  27.27 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  26.41 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  27.09 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.98 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  26.19 
 
 
1347 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  25.32 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  26.77 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  28.09 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  27.05 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  24.79 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  26.34 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  26.72 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  27.11 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  24.49 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.1 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.34 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  25.54 
 
 
413 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  25.8 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  26.1 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  25.86 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  27.2 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.1 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  25.65 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05210  Na+/serine symporter  27.78 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.846221  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  24.63 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  24.82 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.14 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  24.38 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25.4 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  26.2 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  27.15 
 
 
415 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  25.8 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>