More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0858 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  44.73 
 
 
901 aa  803    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  44.73 
 
 
901 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  49.18 
 
 
897 aa  868    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  44.58 
 
 
911 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 
922 aa  767    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  46.08 
 
 
842 aa  775    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  44.93 
 
 
868 aa  796    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  45.31 
 
 
934 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  44 
 
 
893 aa  775    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  44.09 
 
 
910 aa  785    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  45.29 
 
 
906 aa  777    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  42.87 
 
 
908 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  44.39 
 
 
922 aa  791    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  44.1 
 
 
917 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  43.61 
 
 
921 aa  787    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  45.95 
 
 
896 aa  826    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  46.05 
 
 
896 aa  827    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  45.52 
 
 
947 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  41.88 
 
 
929 aa  707    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  44.84 
 
 
904 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.83 
 
 
968 aa  768    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  45.86 
 
 
942 aa  738    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 
924 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  45.52 
 
 
862 aa  784    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  45 
 
 
923 aa  802    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  43.52 
 
 
953 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  45.05 
 
 
930 aa  735    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  46.39 
 
 
903 aa  861    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 
943 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  43.93 
 
 
908 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  46.1 
 
 
896 aa  806    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  46.25 
 
 
932 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 
937 aa  728    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  45.46 
 
 
934 aa  745    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  46.78 
 
 
899 aa  823    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  44.76 
 
 
944 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  43.44 
 
 
910 aa  769    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  46.72 
 
 
912 aa  837    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  43.96 
 
 
943 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  44.42 
 
 
948 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  45.38 
 
 
917 aa  823    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  45.44 
 
 
896 aa  801    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  49.74 
 
 
896 aa  882    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 
930 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  44.8 
 
 
962 aa  832    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  46.77 
 
 
994 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  43.65 
 
 
946 aa  766    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 
911 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  43.23 
 
 
933 aa  786    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  45.93 
 
 
862 aa  800    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  42.56 
 
 
921 aa  752    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 
917 aa  793    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  44.15 
 
 
947 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  45.25 
 
 
908 aa  834    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  43.14 
 
 
921 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  45.78 
 
 
936 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44.35 
 
 
907 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  43.65 
 
 
946 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  46.47 
 
 
912 aa  834    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  44.46 
 
 
951 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  42.05 
 
 
926 aa  709    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  45.18 
 
 
930 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  46.09 
 
 
993 aa  824    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 
869 aa  701    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1762  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 
938 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  43.52 
 
 
911 aa  772    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 
932 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 
947 aa  735    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
951 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 
931 aa  823    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  46.12 
 
 
910 aa  803    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  44.38 
 
 
943 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  44.5 
 
 
943 aa  715    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  44.61 
 
 
898 aa  764    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  45.62 
 
 
936 aa  756    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  45.45 
 
 
918 aa  799    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  44.03 
 
 
908 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  46.31 
 
 
909 aa  838    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
917 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 
931 aa  824    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  42.95 
 
 
955 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  46.69 
 
 
931 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  42.37 
 
 
916 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 
912 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 
932 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  45.17 
 
 
930 aa  733    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  46.4 
 
 
901 aa  829    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  46.75 
 
 
910 aa  840    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  46.38 
 
 
1009 aa  756    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  48.41 
 
 
896 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  44.08 
 
 
901 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  44.04 
 
 
937 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.88 
 
 
908 aa  794    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 
947 aa  735    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  44.63 
 
 
906 aa  765    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>