More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0839 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  200  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
224 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
208 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  83.6  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.22 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  42.16 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  42.45 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  40.2 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  41.18 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  39.22 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  39.81 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  40.2 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  40.2 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  37.86 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  47.62 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.18 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  47.12 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  37.25 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  35.29 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  34.31 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  39.56 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  44.34 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  44.34 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  31.68 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  34.31 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>