More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0792 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  41.25 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  41.18 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  42.14 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  42.14 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  38.69 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  38.16 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  34.97 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  40.94 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0694  shikimate kinase  42.14 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00295001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0694  shikimate kinase  42.14 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.233345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  41.51 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  40.56 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 495 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  41.67 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  34.32 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  37.27 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  39.58 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  38.51 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.14 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  40 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  38.19 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  40 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  40 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  32.95 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  38.93 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  35.91 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  36.25 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  36.3 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  36.73 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.13 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  38.19 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  39.74 
 
 		 177 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  37.5 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  38.31 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  38.89 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  32.14 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  37.14 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  36.81 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  36.36 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  38.26 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  36.88 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  36.91 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  37.76 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  32.72 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  38.62 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  40.41 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  38.36 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  34.27 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  35.09 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  38.36 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  38.03 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  38.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  38.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  34.72 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  38.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  38.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  33.54 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  34.72 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  35.42 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  37.06 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  38.62 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  38.46 
 
 		 277 aa  95.5  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  37.58 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  35.06 
 
 		 196 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  36.94 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  37.42 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  38.26 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  38.26 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  36.11 
 
 		 183 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  36.91 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  34.01 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  34.72 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  31.14 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  39.19 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  32.3 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  30.95 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  33.73 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  36.36 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  36.11 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  34.97 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  38.26 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  35.42 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2728  shikimate kinase II  29.38 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  40.52 
 
 		 161 aa  92.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  35.81 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  37.68 
 
 		 169 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  40.52 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  38.41 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  32.35 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  34.38 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  38.78 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  36.55 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  37.35 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  34.9 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  33.76 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  30.87 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  37.84 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  36.96 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  36.11 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>