More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0746 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  39.53 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  40.41 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  40.41 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  36.84 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  36.02 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  37.13 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  35.95 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  36.99 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  38.33 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  37.08 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  37.39 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  35.2 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.87 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  36.67 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  35.22 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  36.97 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  36.97 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  36.97 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.27 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  35.8 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  36.84 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.65 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  37.97 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.03 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  34.85 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  36.03 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1346  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  36.13 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  38.71 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  36.97 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  34.44 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  34.82 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  37.82 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  36.82 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  34.41 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0391  tRNA pseudouridine synthase A  36.59 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  34.71 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  34.3 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>