More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0541 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
403 aa  788    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  48.36 
 
 
395 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  43.18 
 
 
405 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  42.43 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  42.43 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  42.18 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  42.18 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  42.18 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  42.18 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  42.18 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  42.43 
 
 
405 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  41.94 
 
 
405 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  42.18 
 
 
405 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 
412 aa  325  7e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 
411 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  39.15 
 
 
399 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 
414 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 
420 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  36.55 
 
 
400 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  36.55 
 
 
415 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  35.56 
 
 
420 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  37.83 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  35.75 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  35.5 
 
 
407 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  36.83 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 
398 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  36.31 
 
 
398 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  36.09 
 
 
398 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  36.09 
 
 
398 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  35.95 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  36.39 
 
 
415 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  36.16 
 
 
415 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  32.65 
 
 
413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  28.89 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 
444 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 
444 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 
444 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  29.29 
 
 
424 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  26.91 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  29.02 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  29.02 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  29.02 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.75 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.79 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  29.13 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.27 
 
 
410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.87 
 
 
433 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  28.13 
 
 
417 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26.77 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  27.3 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  26.18 
 
 
413 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.63 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  25.68 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  26 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  25.89 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  25.43 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  25.43 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  25.43 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  26.13 
 
 
423 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  25.65 
 
 
424 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  25.19 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  25.19 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  25.19 
 
 
423 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  25.89 
 
 
423 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  25.19 
 
 
423 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  25.89 
 
 
423 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.6 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  26.13 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  24.94 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  26.24 
 
 
423 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  25.89 
 
 
423 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  27.11 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  25.18 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  26.22 
 
 
416 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.33 
 
 
434 aa  113  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  26.03 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 
419 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 
419 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  24.47 
 
 
422 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 
419 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  25.36 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  24.76 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  24.93 
 
 
435 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  26.67 
 
 
436 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.33 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  25.13 
 
 
419 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  25.39 
 
 
419 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 
449 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  24.86 
 
 
438 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  24.94 
 
 
436 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 
416 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.61 
 
 
420 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  23.48 
 
 
420 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26.03 
 
 
433 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 
416 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>