101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0400 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  37.21 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  31.8 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  30 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  30.19 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  29.49 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  29.49 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  27.78 
 
 
222 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  29.44 
 
 
226 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  28.17 
 
 
225 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  29.73 
 
 
249 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  30.14 
 
 
240 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  27.7 
 
 
226 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  30.52 
 
 
223 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  29.96 
 
 
226 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  29.25 
 
 
240 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  28.38 
 
 
240 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  29.52 
 
 
226 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  32.44 
 
 
221 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  29.49 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  29.3 
 
 
219 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  29.52 
 
 
226 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  29.61 
 
 
226 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  27.98 
 
 
218 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  27.65 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  27.65 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  27.65 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  28.3 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  28.3 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  26.73 
 
 
240 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  30.14 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  30.14 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  30.14 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  30.14 
 
 
219 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  30.09 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  29.91 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  29.44 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  29.28 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  33.01 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  25.85 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  28.17 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  22.69 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  25.11 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  25.35 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  25.35 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  24.2 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  24.77 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  28.23 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  21.97 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  21.96 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  21.96 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  20.49 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  22.58 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  20.19 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  19.71 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  21.05 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  28.08 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  20.57 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  28.7 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  26.96 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  22.58 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  28.97 
 
 
221 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  22.11 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  20.64 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0364  YheO-like  21.24 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0819  YheO domain-containing protein  21.24 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229038  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3937  hypothetical protein  21.24 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0928038  hitchhiker  0.00381937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  21.24 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  21.68 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  25.24 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  25.24 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  23.5 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  20.8 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  20 
 
 
212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  20.8 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  20 
 
 
212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  23.56 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  20 
 
 
212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  21.33 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  20.87 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3430  YheO domain-containing protein  22.17 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  22.9 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  23.77 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  20.47 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  21.36 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  25.23 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  23.26 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>