More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0374 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
149 aa  289  8e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  41.82 
 
 
158 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  39.45 
 
 
143 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.21 
 
 
155 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  36.75 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  29.71 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.01 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
540 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.43 
 
 
146 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  43.93 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.38 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
542 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.17 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  37.41 
 
 
549 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  38.74 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  43.14 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.77 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  32.56 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.29 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  40.19 
 
 
155 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
176 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  31.78 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  36.8 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  31.78 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.4 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.59 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  34.33 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  30.83 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36.57 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.35 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.35 
 
 
187 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36.57 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  37.62 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  37.93 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  33.93 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  32.61 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.86 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  33.98 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.6 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  34.86 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  39.18 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.6 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  34.15 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.6 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.6 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  32.61 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.62 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  34.19 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  36.7 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  41.05 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  36.19 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  31.25 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  30.47 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  39.62 
 
 
504 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  34.29 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  30.95 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  28.86 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.61 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
196 aa  73.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  33.86 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  34.45 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  31.97 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  31.01 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  30.25 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  32.87 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  33.04 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  42 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  35.83 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  36.8 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  32.87 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  34.26 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  33.11 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  42.86 
 
 
497 aa  71.2  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  32.73 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  35.65 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  36.19 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>