294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0319 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  42.37 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  42.37 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  34.11 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  33.88 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  36.72 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  35.94 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  40.38 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  32.32 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  34.15 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2557  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.108447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  36.54 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  37.37 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  38.3 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  35.16 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  36.19 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  39.6 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  39.6 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  39.6 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  33.61 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  31.19 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  36.89 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  39.8 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  29.52 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  36.63 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  35 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  41.49 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  38.71 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  37.14 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  40.82 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  34 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>