159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0309 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 417 aa  837    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  27.51 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.44 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 389 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.46 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.81 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.87 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.51 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.39 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.65 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 792 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  24.73 
 
 		 483 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.76 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.52 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 391 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.13 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.7 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.53 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 1153 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 1040 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24.88 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  24.94 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 		 1061 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.54 
 
 		 1061 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.71 
 
 		 478 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.56 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  20.82 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.2 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.92 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  24.07 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  22.49 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 1096 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  22.45 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  20.43 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  30.65 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  20.1 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.48 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.38 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.48 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  29.84 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.72 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  19.87 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  28.38 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  18.49 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  20.19 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  27.94 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  27.94 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  20.11 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.72 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  21.59 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  19.73 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  20.91 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.45 
 
 		 1111 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  18.46 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  20.48 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  25.67 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  20.9 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  19.02 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  21.59 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.59 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  21.04 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.03 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.78 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  32.32 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 359 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.23 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  24.46 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>