More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0210 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  100 
 
 
172 aa  339  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  37.13 
 
 
167 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 
148 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
160 aa  104  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  104  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
173 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
147 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
148 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
149 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.67 
 
 
147 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
153 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.85 
 
 
191 aa  100  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
199 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.42 
 
 
159 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
151 aa  99.4  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
149 aa  99  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
146 aa  98.6  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
147 aa  97.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
147 aa  97.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
148 aa  97.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  33.71 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  40.6 
 
 
195 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  37.31 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  36.77 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  36.57 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  37.41 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  30.14 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  94.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
149 aa  94.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  36.11 
 
 
148 aa  94.4  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
151 aa  94  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  34.48 
 
 
146 aa  92  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
150 aa  92  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
178 aa  92  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
147 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
148 aa  91.3  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
147 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  33.93 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  35.37 
 
 
150 aa  90.9  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  33.74 
 
 
170 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  30.82 
 
 
148 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  34.03 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  33.1 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
202 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  31.29 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  30.34 
 
 
149 aa  89  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
199 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  40.88 
 
 
210 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  31.29 
 
 
148 aa  89.4  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  35.34 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  32.54 
 
 
193 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  35.66 
 
 
148 aa  87.8  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
147 aa  87.8  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  87.4  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  31.18 
 
 
164 aa  87.4  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  29.93 
 
 
148 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
192 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  28.08 
 
 
149 aa  87  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>