293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0146 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  100 
 
 
460 aa  888    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  44.62 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  47.7 
 
 
447 aa  349  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  42.83 
 
 
452 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  43.56 
 
 
461 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  42.67 
 
 
452 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  44.22 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  42.7 
 
 
447 aa  342  8e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  42.44 
 
 
452 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  42.64 
 
 
452 aa  338  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  42.92 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  42.89 
 
 
452 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  43.64 
 
 
447 aa  335  7.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  43.34 
 
 
452 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  43.11 
 
 
452 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  42.83 
 
 
452 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  42.83 
 
 
452 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  42.83 
 
 
452 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  43.64 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  40.53 
 
 
455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  45.58 
 
 
450 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  43.65 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  42.28 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  40.18 
 
 
455 aa  318  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  43.78 
 
 
452 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  43.78 
 
 
452 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  39.74 
 
 
452 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  43.78 
 
 
452 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  41.91 
 
 
446 aa  302  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  38.88 
 
 
452 aa  302  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  37.47 
 
 
462 aa  300  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  36.76 
 
 
460 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  39.29 
 
 
455 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  40.43 
 
 
453 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  36.92 
 
 
444 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  36.99 
 
 
452 aa  276  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  35.9 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  33.41 
 
 
461 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  33.03 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3262  Gluconate transporter  32.18 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  normal  0.0187026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.06 
 
 
464 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  31.19 
 
 
468 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  29.87 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  29.87 
 
 
450 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  29.87 
 
 
450 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  33.16 
 
 
487 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  32.89 
 
 
452 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  32.91 
 
 
485 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2254  high-affinity gluconate transporter  31.92 
 
 
449 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  30.59 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  30.92 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  30.61 
 
 
450 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  30.28 
 
 
452 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  30.7 
 
 
448 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  30.28 
 
 
452 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  31.04 
 
 
450 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  29.72 
 
 
477 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  29.07 
 
 
450 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1664  gluconate transporter  31.67 
 
 
449 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  29.07 
 
 
450 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  30.38 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3071  high-affinity gluconate transporter  31.25 
 
 
449 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672958  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  33.4 
 
 
494 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  28.98 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  30.49 
 
 
452 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2303  gluconate transporter, permease protein  31.25 
 
 
449 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2786  gluconate transporter  29.33 
 
 
450 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  29.46 
 
 
450 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  28.06 
 
 
450 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  31.9 
 
 
498 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  31.9 
 
 
498 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  31.9 
 
 
498 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  31.9 
 
 
498 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  29.26 
 
 
453 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  31.67 
 
 
498 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  30.53 
 
 
453 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  28.67 
 
 
450 aa  170  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2094  gluconate transporter  31.08 
 
 
449 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  29.96 
 
 
469 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  30.15 
 
 
445 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  28.76 
 
 
449 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  30.73 
 
 
464 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  30.65 
 
 
441 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  30.59 
 
 
447 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  29.77 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  29.77 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  29.77 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  29.77 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  29.13 
 
 
439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  28.31 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  29.82 
 
 
450 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  29.85 
 
 
445 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  30.37 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  30.37 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  30.37 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  30.37 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  30.37 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  29.85 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  29.85 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  29.85 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>